口腔溃疡在过去总被认为是“火气大”的缘故，但是，最近医学界经过临床及免疫研究，已确定其病原为病毒感染，而导致口腔溃疡的两种病毒分别为人类巨细胞病毒和ER病毒。其中人类巨细胞病毒潜伏在血液中的T淋巴细胞，ER病毒则潜伏在血液中的B淋巴细胞，人们一旦感冒、情绪压力大、身体疲倦或精力不足、免疫力差等，病毒就会发作。

      此外，口腔溃疡也被认为与遗传、荷尔蒙等因素有关，如女性月经前口腔溃疡会有恶化情形，更年期妇女则病例有升高现象。中医认为，要改善复发性口腔溃疡应注意排便通畅、睡眠充足，尤其是大便通畅是复发性口腔溃疡治疗过程中不可缺少的治疗法。