可以引起婴儿肝炎综合征的原因很多，可分下列三类：

  (1)肝细胞损害

  巨细胞包涵体病毒(CMV)是我国婴儿肝炎综合征的主要病原，约占1/4；乙肝病毒、EB病毒、败血症、弓形虫病，比较少见；新生儿静脉高营养，如果连续应用2周以上也可引起此病。

  (2) 肝内、外胆管阻塞

  包括肝内胆管发育不良、胆汁粘稠综合征、先天性胆道闭锁和总胆管囊肿等。

  (3)先天性代谢缺陷

  某些先天性代谢疾病，可引起肝脏病变，如α1抗胰蛋白酶缺乏症、半乳糖血症、酪氨酸血症、遗传性果糖不耐受症等。